醫(yī)學診斷
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艾學堂 l “數(shù)字PCR panel檢測”助力肺癌液體活檢
2024-04-28
導讀
? ? ? ? ? 靶向治療在驅(qū)動基因陽性的晚期非小細胞肺癌(NSCLC)患者中療效顯著，表皮生長因子受體酪氨酸激酶抑制劑(EGFR-TKIs)已經(jīng)成為NSCLC的常規(guī)治療。隨著臨床研究的深入，EGFR的突變狀態(tài)也已發(fā)展為全病程多次監(jiān)控，以應(yīng)對不斷變化的病情。循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)是藥物伴隨診斷、反映疾病實時進展的標志物，但其含量少、背景噪音高，對于檢測方法有挑戰(zhàn)。數(shù)字PCR技術(shù)具有的靈敏度和特異性，搭配通量高、位點全、成本低的檢測試劑，將能快速的解析ctDNA，未來能更好的服務(wù)于臨床。
? ? ? ? ? ?近日，滄州中心醫(yī)院宋翔教授團隊和河北中醫(yī)學院中西醫(yī)結(jié)合肝腎病證研究省級重點實驗室楚立教授團隊與艾普拜生物合作，對“數(shù)字PCR panel檢測”技術(shù)的各項性能進行了評估，并用臨床樣本驗證了其在ctDNA療效監(jiān)測上的實戰(zhàn)效果，相關(guān)學術(shù)成果于2020年8月12發(fā)表在British Journal of Cancer雜志上(IF:5.791)。
? ? ? ? ?研究方法: 本研究使用艾普拜生物研發(fā)的“dEGFR39”數(shù)字PCR panel檢測試劑，可單次檢測EGFR的39個突變位點，包括L858R、19Del和T790M等常見突變位點，以及L861Q、S768I、G719X、C797S(cis/trans)和20ins等罕見突變位點。本研究收集了30例NSCLC患者的回顧性FFPE組織和33例NSCLC患者的配對組織、血漿樣本進行分析。
研究結(jié)果:
▼“dEGFR39”試劑分析靈敏度達到0.01%
? ? ? ? ? “dEGFR39”檢測試劑具有高靈敏度，優(yōu)于ARMS-PCR方法。該研究比較了預期突變豐度(0.01%、0.05%、0.1%、1%、10%)與實測豐度的線性關(guān)系，R2接近1。
▼“dEGFR39”試劑具有更高的血漿游離DNA突變檢出率
? ? ? ? ?以33例晚期NSCLC患者的組織樣本突變檢測結(jié)果(ARMS-PCR法)為對照，使用“dEGFR39”試劑盒測試配對血漿樣本，T790M的檢出率提高了60%。
? ? ? ? ? 持續(xù)采集33例患者血漿樣本，同時用dPCR技術(shù)和SuperARMS PCR技術(shù)進行檢測，“dEGFR39”發(fā)現(xiàn)8例患者的13份血漿樣本為T790M突變，而SuperARMS PCR僅能檢出69%(9份)的T790M突變。
▼“dEGFR39”液體活檢指導肺癌個性化治療，提早數(shù)月提示腫瘤進展
? ? ? ? ? ?在埃克替尼治療368天的患者P-15血漿中，除了原L858R突變外，dEGFR39已檢測到耐藥位點T790M的出現(xiàn)，比影像學疾病進展提前121天。類似的，在具有19Del突變的P-25患者身上，也提前影像學43天觀測到耐藥突變位點的出現(xiàn)?；颊逷-23中，隨著?？颂婺岬闹委?，dEGFR39檢測到的L858R的突變豐度不斷下降，CT也顯示患者治療有效。之后發(fā)現(xiàn)T790M豐度上升，及時更換治療方案后患者病情又趨于穩(wěn)定。
優(yōu)勢:
? ? ? ? ? 基于Naica數(shù)字PCR技術(shù)的“dEGFR39”panel檢測方法可靠、靈敏、快速、位點多，在預測EGFR-TKIs治療后的耐藥、治療監(jiān)控及臨床預后等方面體現(xiàn)了明顯的優(yōu)勢。